Chaque système d'osmose inverse sera pollué et devra être nettoyé. Parce qu'il n'y a généralement pas qu'un seul polluant lorsque la pollution se produit, le processus de nettoyage typique comprend généralement deux étapes : un nettoyage à faible pH et un nettoyage à pH élevé.
Différents polluants doivent être nettoyés avec différents agents de nettoyage. Le nettoyage alcalin est principalement utilisé pour éliminer les micro-organismes ou les polluants organiques, et le nettoyage acide est principalement utilisé pour éliminer le tartre. L'agent de nettoyage doit être choisi en fonction du type de polluants et du type de membrane pour éviter d'endommager la membrane.
La séquence d'utilisation des agents de nettoyage doit être déterminée en fonction des problèmes réels. La séquence de nettoyage habituelle est d'abord un lavage à l'acide, puis un lavage à l'alcali.
Dans certains cas, si la pollution est principalement constituée de matières organiques ou de micro-organismes, un lavage alcalin peut être effectué en premier, suivi d'un lavage acide, puis d'un lavage alcalin.
La raison importante de prendre le lavage alcalin comme dernière étape est qu'il peut ouvrir complètement les pores de la membrane après le décapage, de manière à rétablir le flux de production d'eau.
